200.03 Is Rivaroxaban Safe and Effective in Preventing Venous Thromboembolism in COVID-19 Patients: A Systematic Review and Meta-Analysis (2024)

Type of publication:
Conference abstract

Author(s):
Abdelkhalek M.; Elshahat A.; *Aboshehata A.; Baidoun H.; Turk S.; Rashed M.A.; Rzk F.M.; Ellabban M.H.; Elneny M.

Citation:
JACC: Cardiovascular Interventions. Conference: CRT 2024, Cardiovascular Research Technologies. Washington Hilton, Washington, DC United States. 17(4 Supplement) (pp S31-S32), 2024. Date of Publication: 26 Feb 2024.

Abstract:
Background: Rivaroxaban, a novel oral anticoagulant, inhibits factor Xa and has gained significant usage in clinical settings since the onset of the COVID-19 pandemic. It is widely believed that Rivaroxaban effectively reduces the occurrence of thromboembolic events in individuals who have contracted COVID-19. This systematic review and meta-analysis aimed to evaluate the efficacy and safety of Rivaroxaban in preventing thromboembolic events in patients with COVID-19 infection. Method(s): A comprehensive literature search was conducted, and randomized controlled trials (RCTs) and observational studies comparing Rivaroxaban with control groups were included. The primary outcomes assessed were venous thromboembolism, mortality. Safety outcomes, specifically bleeding events. Result(s): A total of 9 studies involving 5484 patients were included in the final analysis. The meta-analysis showed that Rivaroxaban has a significant advantage in preventing venous thromboembolism (RR=0.17, 95% CI [0.06 to 0.54], P=0.002). Regarding mortality, Rivaroxaban was associated with a lower risk compared to the control group (RR=0.55, 95% CI [0.31 to 0.96], P=0.04), particularly in the cardiovascular mortality subgroup (RR=0.14, 95% CI [0.05 to 0.45], P=0.0008). The Rivaroxaban had a higher risk of bleeding events (RR=3.28, 95%CI [1.54 to 6.97], P=0.002). Conclusion(s): This systematic review and meta-analysis suggest that Rivaroxaban effectively reduces mortality and prevents venous thromboembolism. However, it was associated with a higher risk of bleeding events compared to the control group. These findings provide valuable insights into using Rivaroxaban to prevent thromboembolic events. [Formula presented]

Assessing continued benefits of 4C scores for mortality among patients with COVID-19 pneumonitis admitted to a teaching district general hospital (2023)

Type of publication:
Conference abstract

Author(s):
Cox D.; Koshy K.; *Moudgil N.; *Makan A.; *Crawford E.; *Moudgil H.; *Srinivasan K.;

Citation:
Thorax. Conference: British Thoracic Society Winter Meeting 2023. London United Kingdom. 78(Supplement 4) (pp A201), 2023. Date of Publication: November 2023.

Abstract:
Background and Objectives The 4C (Coronavirus Clinical Characterisation Consortium) score incorporating patient comorbidities with measures of acute physiology and inflammation is an internationally validated prognostic tool for in-hospital mortality introduced early during the COVID-19 pandemic. With the subsequent strong uptake of SARS-CoV-2- RNA vaccines, more targeted therapies, changing virulence of the coronavirus (now predominantly omicron), and fewer reported deaths, the goal/objectives of this work were to determine continuing relevance of 4C scores by (1) reporting their distribution categorised with risk profile and (2) further analysing mortality in the immediate in-hospital setting and at 12 months. Methods Retrospective computer-based data including SARSCoV- 2-RNA vaccination status/boosters collected for patients with confirmed infection and COVID-19 pneumonitis admitted during 2 months to July 2022; subsequent analysis for mortality was by regression analysis accepting statistically significant findings for standardised beta coefficients at p<.05 adjusting for demographics, vaccination status and targeted COVID-19 directed (Remdesivir/Tocilizumab) therapeutic variables as well as oxygen (O2) and use of medical devices. Results 62 patients (47% males), with mean (SD, range) age 75.8 (15.4, 32-101) years were identified; 19 (30.6%), with mean survival 70 (67, 6-237) days (median 40 days), had died (9 in the initial admission and 10 during follow up). 55 (88.7%) had been vaccinated at least once. Distribution of 4C scores with mortality in-hospital and during follow up are shown in table 1; 8/9 (88.9%) in-hospital and 17/19 (89.5%) overall deaths were from patients with high or very high 4C scores. Independent variables statistically significant on regression analysis for in-hospital mortality included positively with 4C score (p= .018) and high O2/medical ventilatory devices (p= .000), and negatively with age (p= .048), dexamethasone (p= .046), and targeted COVID treatments (p= .036) but not gender, status/number of vaccines, or low dose O2 use. None of the variables were significant at 12 months. Conclusions Analysis of this real-life data has shown continued role for 4C scores outside of their original validation; despite no statistical significance among independent variables at 12 months, the continued mortality (30.6% in the cohort) likely reflects on the significant burden of co-morbidity.

Increased detection of pericardial effusion during the COVID-19 pandemic (2023)

Type of publication:Conference abstract

Author(s):*Wilson A.; *Ellis C.; *Lee E.

Citation:Echo Research and Practice. Conference: British Society of Echocardiography Annual Meeting, BSEcho 2022. London United Kingdom. 10(Supplement 1) (no pagination), 2023. Date of Publication: September 2023.

Abstract:Background: Pericardial effusions (PE) occur when there is an excess of fluid accumulating within the pericardial space. We have observed an increase in the number of PE's detected amongst all transthoracic echocardiography (TTE) scans performed since the start of the COVID- 19 pandemic irrespective of cause for referral. This is interesting given that the most common cause of PE's in the Western World is considered to be post-viral infection. Aim(s): Validate a significant increase in the rate of PE detection via TTE from January 2020-December 2021 compared to the previous 3 years and compare PE detection with national COVID-19 infection data. Method(s): All TTE scans performed between January 2017 and December 2021 were utilised to generate rates of PE detection. A t-test was performed to assess for a significant difference in PE detection pre-COVID-19 (January 2017-December 2019) and during the pandemic (January 2020-December 2021). Data on the incidence of COVID-19 cases in the UK was gathered from the Gov.uk website. Result(s): A total of 37,069 TTE's were performed pre-COVID-19 and 24,125 scans post-COVID-19. Majority of the 2020-2021 TTE's were performed in low risk COVID-19 patients. There were significantly more PE's detected post-COVID-19 compared with pre-COVID-19 with rates of detection of 0.14 and 0.05 respectively (p < 0.001). Detection of PE's increased from 2017-2021 despite a decrease in total scans performed post-COVID-19 (Figure 1). Comparison with national COVID-19 infection data shows a peak in PE incidence following a peak in infections (Figure 2). Conclusion(s): We have noticed a significant increase in PE detection since the start of the COVID-19 pandemic. This appeared to track the incidence of national COVID-19 infections.

GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19 (2023)

Type of publication:
Journal article

Author(s):
Pairo-Castineira E.; Rawlik K.; Bretherick A.D.; Qi T.; Wu Y.; Nassiri I.; McConkey G.A.; Klaric L.; Kousathanas A.; Richmond A.; Malinauskas T.; Thwaites R.; Morrice K.; Maslove D.; Semple M.G.; Knight J.; Hinds C.; Horby P.; Ling L.; McAuley D.; Montgomery H.; Openshaw P.J.M.; Begg C.; Walsh T.; Tenesa A.; Flores C.; Riancho J.A.; Rojas-Martinez A.; Clohisey S.; Millar J.; Aitkin E.; Aravindan L.; Armstrong R.; Biggs H.; Boz C.; Chikowore P.; Coutts A.; Coyle J.; Cullum L.; Das S.; Day N.; Donnelly L.; Duncan E.; Finernan P.; Fourman M.H.; Furlong A.; Furniss J.; Gallagher B.; Gilchrist T.; Golightly A.; Griffiths F.; Hafezi K.; Hamilton D.; Hendry R.; Kearns N.; Law D.; Law R.; Law S.; Lidstone-Scott R.; Lauder C.; Macgillivray L.; Maclean A.; Mal H.; McCafferty S.; McMaster E.; Meikle J.; Murphy S.; Mybaya H.; Oosthuyzen W.; Zheng C.; Chen J.; Parkinson N.; Paterson T.; Tucker P.; Schon K.; Stenhouse A.; Das M.; Swets M.; Szoor-McElhinney H.; Taneski F.; Turtle L.; Wackett T.; Ward M.; Weaver J.; Wrobel N.; Zechner M.; Pan J.; Grau N.; Jones T.O.; Lim R.; Marotti M.; Whitton C.; Bociek A.; Campos S.; Arbane G.; Shankar-Hari M.; Ostermann M.; Cha M.; DAmato F.; Kosifidou E.; Lorah S.; Morera K.; Brady L.; Hugill K.; Henning J.; Bonner S.; Headlam E.; List A.; Morley J.; Welford A.; Kamangu B.; Ratnakumar A.; Shoremekun A.; Alldis Z.; Astin-Chamberlain R.; Bibi F.; Biddle J.; Blow S.; Bolton M.; Borra C.; Bowles R.; Burton M.; Choudhury Y.; Cox A.; Ebano P.; Fotiadis S.; Gurasashvili J.; Halls R.; Hartridge P.; Kallon D.; Kassam J.; Lancoma-Malcolm I.; Matharu M.; May P.; Mitchelmore O.; Newman T.; Patel M.; Pheby J.; Pinzuti I.; Prime Z.; Prysyazhna O.; Shiel J.; Tierney C.; Zongo O.; Zak A.; Mundy M.; Thompson C.; Pritchard L.; Gellamucho M.; Cartlidge D.; Bandla N.; Bailey L.; Delaney J.; Scott L.; Abdelrazik M.; Alasdair F.; Carter D.; Elhassan M.; Ganesan A.; Lamond Z.; Purohit D.; Rohit K.; Saleem M.; Wall A.; Xavier K.; Bakthavatsalam D.; Gehad K.; Gnanapragasam P.; Jain K.; Jain S.; Malik A.; Pappachan N.; Moreno-Cuesta J.; Haldeos A.; Vincent R.; Oziegb M.; Cavazza A.; Cockrell M.; Corcoran E.; Depante M.; Finney C.; Jerome E.; Knighton A.; Nayak M.; Pappa E.; Saha S.; Dodd A.; O'Reilly K.; McPhail M.; Clarey E.; Noble H.; Coghlan P.; Brett S.; Gordon A.; Templeton M.; Antcliffe D.; Banach D.; Darnell S.; Fernandez Z.; Jepson E.; Mohammed A.; Rojo R.; Arias S.S.; Gurung A.T.; Fernandez-Roman J.; Hamilton D.O.; Johnson E.; Johnston B.; Martinez M.L.; Mulla S.; Waite A.A.C.; Williams K.; Waugh V.; Welters I.; Emblem J.; Norris M.; Shaw D.; Bashyal A.; Beer S.; Hutton P.; McKechnie S.; Davidson N.; Readion G.; Ryu J.; Wilson J.; Agrawal S.; Elston K.; Jones M.; Meaney E.; Polgarova P.; Elbehery M.; Summers C.; Daubney E.; Ng A.; Marshall J.; Pathan N.; Stroud K.; White D.; Andrew A.; Ashraf S.; Dent M.; Langley M.; Peters C.; Ryan L.; Sampson J.; Wei S.; Baddeley A.; Meredith M.; Morris L.; Gibbons A.; McLoughlin L.; Delgado C.C.; Clark V.; Dawson D.; Ding L.; Durrant G.; Ezeobu O.; Hurt W.J.; Kanu R.; Kinch A.; Leaver S.; Lisboa A.; Mathew J.; Patel K.; Saluzzio R.P.; Rawlins J.; Samakomva T.; Shah N.; Sicat C.; Texeira J.; De Queiroz J.G.; Da Gloria E.F.; Maccacari E.; Yun N.; Manna S.; Farnell-Ward S.; Maizcordoba M.; Thanasi M.; Ali H.H.; Hastings J.; Grauslyte L.; Hussain M.; Ruge B.; King S.; Pogreban T.; Rosaroso L.; Smith H.; Phull M.-K.; *Adams N.; Franke G.; George A.; Salciute E.; Wong J.; Dunne K.; Flower L.; Sharland E.; Sra S.; Andrew G.; Callaghan M.; Barclay L.; Baillie K.; Hope D.; Mcculloch C.; Allen M.; Baptista D.; Crowe R.; Fox J.; Khera J.; Loveridge A.; McKenley I.; Morino E.; Naranjo A.; O'Connor D.; Simms R.; Sollesta K.; Swain A.; Herdman-Grant R.; Joseph A.; Nown A.; Rose S.; Pogson D.; Boxall H.; Brimfield L.; Claridge H.; Daly Z.; George S.; Gribbin A.; Cheema Y.; Cutler S.; Richards O.; Roynon-Reed A.; Cherian S.; Heron A.E.; Williams G.; Szakmany T.; Waters A.; Dunhill J.; Jones F.; Morris R.; Ship L.; Cardwell A.; Ali S.; Bhatterjee R.; Bolton R.; Chukkambotla S.; Coleman D.; Dalziel J.; Dykes J.; Fine C.; Gay B.; Goddard W.; Goodchild D.; Harling R.; Hijazi M.; Keith S.; Khan M.; Matt R.; Ryan-Smith J.; Saad S.; Springle P.; Thomas J.; Truman N.; Kazi A.; Smith M.; Collier H.; Davison C.; Duberley S.; Hargreaves J.; Hartley J.; Patel T.; Kent A.; Goodwin E.; Zaki A.; Tibke C.; Hopkins S.; Gerrard H.; Jackson M.; Bennett S.; Mills R.; Bell J.; Campbell H.; Dawson A.; Dodds S.; Duffy S.; Gallagher L.; McCafferty G.; Short S.; Thomas K.; Walker C.; Reynolds J.; Yates B.; McKie H.; Panteli M.; Thompson M.; Waddell G.; De Beger S.; Abraheem A.; Dunmore C.; Girach R.; Jones R.; London E.; Nagra I.; Nasir F.; Sainsbury H.; Smedley C.; Brearey S.; Burchett C.; Faulkner M.; Jeffrey H.; Bamford P.; Shaikh F.; Slack L.; Davies A.; Brooke H.; Suarez J.C.; Charlesworth R.; Hansson K.; Norris J.; Poole A.; Sandhu R.; Smithson E.; Thirumaran M.; Wagstaff V.; Buckley S.; Sloan B.; Rose A.; Major A.; Metcalfe A.; Almaden-Boyle C.; Austin P.; Chapman S.; Eros A.; Cabrelli L.; Cole S.; Whyte C.; Casey M.; Bafitis V.; Tsinaslanidis G.; George C.; Khade R.; Black C.; Ashok S.R.; Farley S.; Brinkworth E.; Harford R.; Murphy C.; Williams M.; Newey L.; Toghill H.; Lewis S.; Rees T.; Battle C.; Baker M.; Travers J.; Chesters K.; Baxter N.; Arnott A.; McCreath G.; Rooney L.; Sim M.; Henderson S.; Dalton C.; Kennedy-Hay S.; O'Donohoe L.; O'Hare M.; Orlikowska I.; McNeela F.; Lyle A.; Hughes A.; Radhakrishnan J.; Gibson S.; Bancroft H.; Bellamy M.; Daglish J.; Kadiri S.; Moore F.; Rhodes J.; Sangombe M.; Peterkin Z.; Carmody M.; Cottle J.; Peasgood E.; de Gordoa L.O.-R.; Cinquina Z.; Howard K.; Joy R.; Roche S.; Birkinshaw I.; Carter J.; Ingham J.; Marshall N.; Pearson H.; Scott Z.; Dasgin J.; Gill J.; Nilsson A.; Hull D.; Ahmadhaider N.; Bates M.; McGhee C.; Ellis H.; Howe G.S.; Singh J.; Stroud N.; Lynch C.; Krishnamurthy V.; Lim L.; Jha R.; Egan J.; Felton T.; Glasgow S.; Padden G.; Choudhr O.; Moss S.; Lingeswaran S.; Alexander P.; Fiouni S.; Ward L.; Allen S.; Shaw J.; Smith C.; Adanini O.; Collins R.; Msiska M.; Ofori L.; Bhatia N.; Dolan H.; Brunton M.; Caterson J.; Coles H.; Keating L.; Tilney E.; Jacques N.; Frise M.; Armistead J.; Bartley S.; Bhuie P.; Rai S.; Tomkova G.; Greer S.; Shuker K.; Tridente A.; Dobson E.; Tully R.; Dearden J.; Drummond A.; Kamath P.; Mulcahy M.; Munt S.; O'Connor G.; Philbin J.; Rishton C.; Scott C.; Winnard S.; Hasni N.; Gascoyne R.; Hawes J.; Pritchard K.; Stevenson L.; Whileman A.; Beavis S.; Bishop L.; Cart C.; Dale K.; Kelly-Baxter M.; Mendelski A.; Moakes E.; Smith R.; Woodward J.; Wright S.; Allan A.; Botello A.; Liew J.; Medhora J.; Trumper E.; Savage F.; Scott T.; Place M.; Kaye C.; Benyon S.; Marriott S.; Park L.; Quinn H.; Skyes D.; Zitter L.; Baines K.; Gordon E.; Keenan S.; Pitt A.; Duffy K.; Ireland J.; Semple G.; Turner L.; Cathcart S.; Rimmer D.; Puxty A.; Puxty K.; Hurst A.; Miller J.; Speirs S.; Bradshaw Z.; Brown J.; Melling S.; Preston S.; Slawson N.; Warden S.; Beasley A.; Stoddard E.; Benham L.; Cupitt J.; Caswell M.; Elawamy L.; Wignall A.; Roberts B.; Golding H.; Leggett S.; Male M.; Marani M.; Prager K.; Williams T.; Golder K.; Jones O.; Cusack R.; Bolger C.; Burnish R.; Carter M.; Jackson S.; Salmon K.; Biss J.; Aquino M.; Croft M.; Frost V.; White I.; Govender K.; Webb N.; Stapleton L.; Wells C.; Nikitas N.; Sanchez-Rodriguez A.; Spencer K.; Stowe B.; Izzard Y.; Poole M.; Monnery S.; Trotman S.; Beech V.; Combes E.; Joefield T.; Covernton P.; Savage S.; Woodward E.; Camsooksai J.; Reschreiter H.; Barclay C.; DeAth Y.; Dube J.; Humphrey C.; Jenkins S.; Langridge E.; Milne R.; Wadams B.; Woolcock M.; Brett M.; Digby B.; Gemmell L.; Hornsby J.; MacGoey P.; O'Neil P.; Price R.; Sundaram R.; Abel L.; Rodden N.; Thomson N.; Rooney K.; Currie S.; Parker N.; Walker L.; Henderson P.; Ogg B.; Whiteley S.; Wilby L.; Long K.; Matthew S.; Salada S.; Trott S.; Watts S.; Friar Z.; Speight A.; Bastion V.; Chandna H.; Djeugam B.; Haseeb M.; Kent H.; Lubimbi G.; Murdoch S.; David B.; Lorusso R.; Vochin A.; Penacerrada M.; Wulandari R.; Heath C.; Jakkula S.; Morris A.; Ahmed A.; Nune A.; Buttriss C.; Whitaker E.; Davey M.; Golden D.; Acklery A.; Fernandes F.; Seaman B.; Earl V.; Collins A.; Adam R.; Treus E.; Holland S.; Alfonso J.; Bruce M.; Durrans L.J.; Eltayeb A.; Hey S.; Hruska M.; Lamb T.; Rothwell J.; Fitzgerald A.; Lindergard G.; T-Michael H.; Duncan T.; Baxter-Dore S.; Fox C.; Guerin J.; Hodgkiss T.; Connolly K.; McAlinden P.; Bridgett V.; Fearby M.; Gulati A.; Hanson H.; Kelly S.; McCormack L.; Nixon R.; Robinson P.; Slater V.; Stephenson E.; Webster A.; Webster K.; Hays C.; Hudson A.; Clement I.; Davis J.; Francis S.; Jerry D.; Abernathy C.; Foster L.; Gratrix A.; Cabral-Ortega L.; Hines M.; Martinson V.; Stones E.; Winter K.; Barrow E.; Wylie K.; Baines D.; Kolakaluri L.; Clark R.; Sukumaran A.; Brandwood C.; Barker M.; Paripoorani D.; Taylor C.; Downes C.; Hayman M.; Riches K.; Daniel P.; Subramanian D.; Holding K.; Hilton M.; McDonald C.; Richardson G.; Halladay G.; Harding P.; Reddy A.; Turner-Bone I.; Wilding L.; Parker R.; Lloyd M.; Smith L.; Kelly C.; Lazo M.; Neal A.; Walton O.; Melville J.; Naisbitt J.; Bullock E.; Joseph R.; Callam S.; Hudig L.; Keshet-Price J.; Stammers K.; Convery K.; Randell G.; Fottrell-Gould D.; Mwaura E.; Sutherland S.-B.; Stewart R.; Mew L.; Wren L.; Thrasyvoulou L.; Willis H.; Scriven J.; Hopkins B.; Lenton D.; Roberts A.; Bokhari M.; Lucas R.; McCormick W.; Ritzema J.; Linnett V.; Sanderson A.; Wild H.; Flanagan R.; Hull R.; Rhead K.; McKenna E.; Hughes G.; Anderson J.; Jones K.; Latham S.; Riley H.; Coulding M.; Mercer O.; Potla D.; Rehman H.; Savill H.; Turner V.; Jude E.; Kilroy S.; Apetri E.; Basikolo C.; Blackledge B.; Catlow L.; Collis M.; Doonan R.; Harris J.; Harvey A.; Knowles K.; Lee S.; Lomas D.; Lyons C.; McMorrow L.; Michael A.; Pendlebury J.; Perez J.; Poulaka M.; Proudfoot N.; Slevin K.; Thomas V.; Walker D.; Dark P.; Charles B.; McLaughlan D.; Slaughter M.; Horner D.; Cawley K.; Marsden T.; Andrews J.; Beech E.; Akinkugbe O.; Bamford A.; Belfield H.; Jones G.A.L.; McHugh T.; Meghari H.; Ray S.; Tomas A.L.; O'Neill L.; Peters M.; Bell M.; Benkenstein S.; Chisholm C.; Kupiec K.; Payne C.; Halls J.; Blakemore H.; Goff E.; Hayes K.; Smith K.; Stephens D.; Worner R.; Borislavova B.; Faulkner B.; Thomas M.; Cookson R.; Gendall E.; Larman G.; Pope R.; Smalira A.; Priestley V.; Cosier T.; Millen G.; Rand J.; Schumacher N.; Sandhar R.; Weston H.; Richardson N.; Cooper L.; Jones C.; Huang Y.-W.J.; Jacob R.; Denmade C.; McIntyre L.; Trodd D.; Martin J.; Watson G.; Bevan E.; Wreybrown C.; Bano S.; Bellwood R.; Bentley M.; Bromley M.; Gurr L.; Ledgard C.; McGowan J.; Pye K.; Sellick K.; Stacey A.; Warren D.; Wilkinson B.; Akeroyd L.; Shafique H.; Morgan J.; Shorter S.; Swinger R.; Waters E.; Lawton T.; Allan E.; Darlington K.; Davies F.; Davies L.; Easton J.; Kumar S.; Lean R.; Mackay C.; Pugh R.; Qiu X.; Rees S.; Scanlon J.; Lewis J.; Menzies D.; Bolger A.; Davies G.; Davies J.; Garrod E.; Jones H.; Manley R.; Williams H.; Frankham J.; Pitts S.; Branney D.; Tiller H.; Efford G.; Garland Z.; Grimmer L.; Gumbrill B.; Johnson R.; Sweet K.; Bewley J.; Coleman C.; Corcoran K.; Morano E.M.H.; Shiel R.; Webster D.; Bonnici J.; Daniel E.; Dell A.; Kent M.; Wilkinson A.; Brown E.; Kay A.; Campbell S.; Cowton A.; Greenaway V.; Potts K.; Hutton C.; Shepperson A.; Forsey M.; Vertue M.; Riches J.; Kaliappan A.; MacCallum N.; Bercades G.; Hass I.; Martir G.; Reyes A.; Smyth D.; Zapatamartinez M.; Alvaro A.; Jetha C.; Ma L.; Booker L.; Mostoles L.; Pratley A.; Altabaibeh A.; Parmar C.; Gilbert K.; Ferguson S.; Shepherd A.; Morris S.; Singleton J.; Baruah R.; Amamio M.; Birch S.; Briton K.; Clark S.; Doverman K.; Marshall L.; Simpson S.; Lloyd G.; Bell S.; Rivers V.; Purewal B.; Hammerton K.; Oleary R.; Cornell S.; Jarmain J.; Rogerson K.; Wakinshaw F.; Woods L.; Rostron A.; Elcioglu Z.; Roy A.; Bell G.; Dickson H.; Wilcox L.; Katary A.; English K.; Hutter J.; Pawley C.; Doble P.; Shovelton C.; Vaida M.; Purnell R.; Cagova L.; Fofano A.; Holcombe H.; Mitchell A.M.; Mwaura L.; Raman K.P.; Garnr L.; Mepham S.; Paques K.; Vuylsteke A.; Mackie J.; Pearn C.; Zamikula J.; Birt M.; Gude E.T.; Nyirenda M.; Capozzi L.; Reece-Anthony R.; Khaliq W.; Noor H.; Nilo A.C.; Grove M.; Daniel A.; Finn J.; White N.; Saha R.; Badal B.; Ixer K.; Duffin D.; Player B.; Hill H.; Davies M.; Davies R.; Hunt L.; Thomas E.; Oblak M.; Thankachen M.; Irisari J.; Sayan A.; Popescu M.; Finch C.; Jamieson A.; Quinn A.; Cooper J.; Liderth S.; Waddington N.; Burn I.; Manso K.; Penn R.; Tebbutt J.; Thornton D.; Winchester J.; Hambrook G.; Shanmugasundaram P.; Craig J.; Simpson K.; Sibbett L.; Paine S.; Conyngham J.-A.; Mupudzi M.D.; Thomas R.; Wright M.; Griffin D.; Partridge R.; Corral M.A.; Muchenje N.; Sitonik M.; Brown C.W.; Butler A.; Folkes L.; Fox H.; Gardner A.; Helm D.; Hobden G.; King K.; Margalef J.; Margarson M.; Martindale T.; Meadows E.; Raynard D.; Thirlwall Y.; Baird Y.; Gomez R.; Hodgson L.; Corin C.; Sidall E.; Szabo D.; Floyd S.; Davies H.; Austin K.; Kelsall O.; Wood H.; Anderson P.; Archer K.; Burtenshaw A.; Clayton S.; Cother N.; Cowley N.; Davis C.; Digby S.; Durie A.; Harrison A.; Low E.; McAlindon M.; McCurdy A.; Morgan A.; Rankin T.; Thrush J.; Tranter H.; Vigurs C.; Wild L.; Cornell T.; Ralph K.; Bean S.; Burt K.; Spivey M.; Richards C.; Tedstone R.; Carmody S.; Zhao X.; Page V.; Guanco M.L.; Hoxha E.; Zorloni C.; Dean C.; Jones E.; Carter E.; Dunn J.; Kong T.; Mahenthran M.; Marsh C.; Holland M.; Keenan N.; Mahmoud M.; Lyons M.; Bradley-Potts J.; Wassall H.; Young M.; Bradley P.; Burda D.; Donlon S.; Harden L.; Harris C.; Mayangao I.; Montaser R.; Mtuwa S.; Piercy C.; Smith E.; Stone S.; Verula J.; Blackman H.; Marriott C.; Michalak N.; Creagh-Brown B.; Salberg A.; Boyer N.; Pristopan V.; Walker R.; Hormis A.; Collier D.; Graham C.; Maynard V.; McCormick J.; Warrington J.; Cosgrove D.; McFarland D.; Ratcliffe J.; Charnock R.; Wynter I.; Gill M.; Kirk J.; Paul P.; Ratnam V.; Shelton S.; Jardine C.; Hay A.; Williams D.; Deacon B.; Durga L.; Hibbert M.; Kennard-Holden G.; Woodford C.; Pothecary C.; Tetla D.; Agravante K.; Smeaton J.; Price A.; Thomas A.; Thorpe C.; Knights E.; Ward D.; Laha S.; Verlander M.; Williams A.; Prout R.; Langton H.; Watters M.; Hunt C.; Novis C.; Arif S.; Cunningham A.; Hewitt C.; Hindale J.; Jackson-Lawrence K.; Shepardson S.; Wills M.; Butler S.; Tavares S.; Barber R.; Hilldrith A.; Hubbard K.; Egginton D.; Clark M.; Purvis S.; Sinclair S.; Collins V.; Landeg B.; Sell C.; Coetzee S.; Gales A.; Icke B.; Raj M.; Williams C.; Williams J.; Hill L.; Kayani A.; Masunda B.; Gondo P.; Atayeva N.; Cruz C.; Pattison N.; Burnett C.; Hatton J.; Heeney E.; Newton M.; Al-Moasseb H.; Behan T.; Stead R.; Mitra A.; Humphreys S.; Cockerill H.; Tampsett R.; Postovalova E.; Coventry T.; Fowler S.; Macmahon M.; Cochrane P.; Pirie S.; Hanley S.; Ali A.; Brady M.; Dale S.; Dance A.; Gledhill L.; Greig J.; Hanson K.; Holdroyd K.; Home M.; Ishaq T.; Kelly D.; Matapure L.; Melia D.; Mellor S.; Merwaha E.; Nortcliffe T.; Shaw L.; Shaw R.; Wood T.; Bayo L.-A.; Usher M.; Wilson A.; Kitson R.; Pinnell J.; Robinson M.; Boltwood K.; Birch J.; Bough L.; Tutton R.; Winter-Goodwin B.; Goodsell J.; Taylor K.; Williams P.; Williams S.; Cave A.; Rees J.; Imeson-Wood J.; Amin V.; Karthik K.; Kausar R.; Anastasescu E.; Reid K.; Anumakonda V.; Stoddart E.; Demetriou C.; Eckbad C.; Howie L.; Mitchard S.; Ramos L.; White K.; Hierons S.; Kelly F.; Serrano-Ruiz A.; Evans G.; Nicol L.; Wilkins J.; Hulacka K.; Debreceni G.; Crickmore V.; Hill K.; Kannan T.; Dagutao Z.; Beesley K.; Lewis A.; Perry J.; Antony S.; Board S.; Buckley C.; Pippard L.; Tanate A.; Wood D.; Kubisz-Pudelko A.; Gouda A.; Auld F.; Donnachie J.; Murdoch E.; Prentice L.; Runciman N.; Senaratne D.; Short A.; Sweeney L.; Symon L.; Todd A.; Turner P.; McCann E.; Salutous D.; Edmond I.; Whitelaw L.; Venkatesh H.; Bland Y.; Kajtor I.; Kavanagh L.; 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Botfield L.; Dexter C.; Kuravi A.; Butler J.; Chadwick R.; Ranga P.; Richardson L.; Virgilio E.; Anwer M.; Garg A.; Botfield D.; Marriott X.; Stewart K.; Phillips C.; Nowak J.; Skinner D.; Jones S.; Crawley R.; Crew A.; Cunningham M.; Daniels A.; Harrison L.; Hope S.; Lancaster N.; Matthews J.; Wray G.; Nicholson A.; Inweregbu K.; Cutts S.; Miller K.; Brady A.; Chan R.; McIvor S.; Prady H.; Mathew B.; Little J.; Furniss T.; Wright C.; King B.; Wasson C.; O'Neill A.; Turley C.; McGuigan P.; Collins E.; Finn S.; Green J.; McAuley J.; Nair A.; Quinn C.; Tauro S.; Ward K.; McGinlay M.; Reddy K.; Ahmad N.; Anderson S.; Barker J.; Bauchmuller K.; Birchall K.; Bird S.; Cawthron K.; Chetam L.; Cole J.; Donne B.; Foote D.; Ford A.; Hanratty H.; Harrington K.; Hesseldon L.; Housley K.; Jackson Y.; Jarman C.; Kibutu F.; Lenagh B.; Macharia I.; Masuko S.; Milner L.; Newell H.; Nwafor L.; Oxspring S.; Phillips P.; Raithatha A.; Rowland-Jones S.; Smith J.; Thompson R.; Trower H.; Walker S.; Watson J.; Wiles M.; Lye A.; Willson J.; Mills G.; Harris S.; Hartill E.; Barron A.; Collins C.; Kaul S.; Nolan C.; Polgar O.; Prendergast C.; Rogers P.; Shokkar R.; Woodruff M.; Mahay K.; Thwaites V.; Reed A.; Meyrick H.; Passmore H.; Farwell J.; Brown A.; Gregory J.; Armstrong D.; Bowey A.; Cowley A.; Corner A.; Highgate J.; Rutherfurd C.; Taylor J.-A.; Goodwin S.; Rutherford C.; Eapen B.; Trim F.; Donnison P.; Armstrong L.; Bates H.; Dooks E.; Farquhar F.; Kitching A.; McParland C.; Packham S.; Hairsine B.; Andreou P.; Hales D.; Mathews M.; Patel R.; Barry P.; Flint N.; Hailstone J.; Ghuman N.; Leonard B.; Lees R.; Butcher D.; Leng K.; Butterworth-Cowin N.; O'Sullivan S.; Ghosh A.; Adams C.; *Agasou A.; *Arden T.; *Beekes M.; *Bowes A.; *Boyle P.; *Button H.; *Carnahan M.; *Carter A.; *Childs D.; *Gaylard J.; *Hurford F.; *Hussain Y.; *Javaid A.; *Jones J.; *Leigh M.; *Martin T.; *Millward H.; *Motherwell N.; *Mullan D.; *Newman J.; *Rikunenko R.; *Stickley J.; *Summers J.; *Ting L.; *Tivenan H.; *Donaldson D.; *Capps N.; *Cale E.; *Osbourne W.; *Pajak S.; *Rankin J.; *Tonks L.; Baird T.; Harkins M.; Ruddy J.; West J.; Duffield J.; Mallon L.; Smith O.; Smuts S.; Campbell A.; Davies C.; Davies S.; Jobes L.; Whitehead V.; Watkins C.; Bowman F.; Milligan B.; McPherson L.; Metherell S.; Harris N.; Lake V.; Radford E.; Smallwood A.; Gopal S.; Vassell K.; Bell D.; Boyle R.; Douglas K.; Glass L.; Lennon L.; Rattray A.; Beith C.; Lee E.; Parsons P.; Attwood B.; Jefferson P.; Ranganathan M.; Atwal I.; Campbell B.; Day A.; Stagg C.; Haynes E.; Ahmed C.; Clamp S.; Colley J.; Haq R.; Hayes A.; Joseph S.; Maqsood Z.; Hussain S.; Hulme J.; Domingos P.; Kumar R.; Purewal M.; Taylor B.; Bunni L.; Latif M.; Jennings C.; Jose S.; Marshall R.; Metryka A.; Subramanian G.; Burgoyne A.; O'Connell S.; Tyler A.; Waldron J.; Hilltout P.; Evitts J.; Ward G.; Bremmer P.; Hawkins C.; Jackman S.; Ogorek M.; Ashby K.; Thornton L.; Mercer P.; Halkes M.; Revill A.; Saint B.; Fletcher J.; Netherton K.; Chablani M.; Kirkby A.; Roper A.; Szymiczek K.; Sutherland I.; O'Brien L.; Connell J.; Davies K.; Lewis T.; Omar Z.; Perkins E.; Roche L.; Sathe S.; Davies E.; Lyon A.; Mapfunde I.; Willis C.; Hitchcock R.; Hall K.; King C.; Fagan A.; Nazari R.; Worsley L.; Allibone S.; Kasipandian V.; Patel A.; Cutting P.; Genetu R.; Mac A.; Murphy A.; Ward S.; Butt F.; Ayers A.; Harrison W.; Mackintosh K.; North J.; Ashton L.; Bi R.; Owen S.; Winmill H.; Scholefield B.; Blowing H.; Williams E.; Duskova M.; Edwards M.; Rees A.; Thomas H.; Hughes R.; Brooks J.; Phipps J.; Brooks S.; Dennis C.; Srikaran S.; Sukha A.; Tiongson G.; Adams K.; Andrew B.; Brayne A.; Carter S.; Findlay L.; Fisher E.; Jackson P.; Kaye D.; Parkin J.; Tuckey V.; Hunt J.; Love N.; van Koutrick L.; Hanson A.; Dent K.; Horsley E.; Pearson S.; Spencer S.; Hutchinson D.; Player J.; Potoczna D.; Akhtar M.N.; Cottam L.-J.; Nauyokas K.; Sanders J.; Garcia S.M.; Pakou G.; Diaba C.; Filipe H.; John L.; Maharajh A.; de Neef M.; Martin D.; Eastgate C.; 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de la Horra C.; de la Hoz A.B.; De Martino-Rodriguez A.; de Sousa Alves Neri J.L.; del Campo-Perez V.; Delgado-Cuesta J.; Diaz-Caneja C.M.; Diaz-Perez A.; de Bustamante A.D.; Dietl B.; Diz-de Almeida S.; Alves M.M.; Dominguez-Garrido E.; dos Santos K.A.; Duarte A.M.; Echave-Sustaeta J.; Eiros R.; Enciso-Olivera C.O.; Escudero G.; Espana P.P.; Sanabria G.M.E.; Farinas M.C.; Fernandes M.R.; Fernandez R.; Fernandez-Caballero L.; Fernandez-Cruz A.; Fernandez-Nestosa M.J.; Fernandez-Robelo U.; Fernandez-Rodriguez A.; Fernandez-Sampedro M.; Fernandez-Sanchez R.; Fernandez-Villa T.; Ferrero S.F.; Martinez Y.F.; Capitan C.F.; Flores-Perez P.; Friaza V.; Fuenmayor-Hernandez L.; Nunez M.F.; Fumado V.; Gadea I.; Gagliardi L.; Gago-Dominguez M.; Gallego N.; Galoppo C.; Garcia I.; Garcia M.; Garcia L.; Garcia-Cerrada C.; Garcia-de-Vicuna A.; Garcia-Garcia J.; Garcia-Garcia I.; Garcia-Ibarbia C.; Garcia-Montero A.C.; Garcia-Soidan A.; Garcia-Vazquez E.; Torrejon M.C.G.; Garza-Frias E.; Gentile A.; Gil-Fournier B.; 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Candon A.M.; Aguilar P.M.; Martin M.M.; Martin M.D.; Martin V.; Martin-Fernandez M.; Martin-Lopez C.; Martin-Oterino J.-A.; Martin-Pedraza L.; Martin-Vicente M.; Martinez A.; Martinez R.; Martinez J.J.; Martinez S.; Martinez-Aquino E.; Martinez-Gonzalez O.; Martinez-Lopez I.; Martinez-Nieto O.; Martinez-Paz P.; Martinez-Perez A.; Martinez-Ramas A.; Martinez-Resendez M.F.; Robles V.M.; Marzal L.; Mazzeu J.F.; Medeiros J.F.P.; Medeiros K.A.; Medrano F.J.; Meijome X.M.; Mejuto-Montero N.; Mendez-Echevarria A.; Charris H.M.; Macias E.M.; Mercadillo F.; Mercado-Sesma A.R.; Minguez P.; Molina A.J.J.; Molina-Roldan E.; Montoya J.J.; Moraes V.M.S.; Moreira-Escriche P.; Morelos-Arnedo X.; Moreno-Docon A.; Moreno-Escalante J.; Cuerda V.M.; Fernandez A.M.; Morilla R.; Garcia P.M.; Neira P.; Nevado J.; Nieto-Ganan I.; Nunes J.F.R.; Nunez-Torres R.; Obrador-Hevia A.; Ocejo-Vinyals J.G.; Olivar V.; Oliveira S.F.; Ondo L.; Orfao A.; Ortega L.; Ortega-Paino E.; Ortiz-Flores F.; Ortiz-Lopez R.; Oteo J.A.; Pachajoa H.; Pacheco M.; Pacheco-Miranda F.J.; Conejo I.P.; Panadero-Fajardo S.; Parellada M.; Pariente-Rodriguez R.; Paz-Artal E.; Peces-Barba G.; Pedromingo Kus M.S.; Perales C.; Perez P.; Perez C.; Perez-de-Nanclares G.; Perez-Garcia F.; Perez-Matute P.; Perez-Serra A.; Perez-Tomas M.E.; Perucho T.; Pichardo L.A.; Pinho S.M.T.; Pinsach-Abuin M.; Pinzon L.A.; Pita G.; Pla-Junca F.; Planas-Serra L.; Pompa-Mera E.N.; Porras-Hurtado G.L.; Pujol A.; Chavez M.E.Q.; Quijada M.A.; Quintela I.; Ramirez-Montano D.; Leon S.R.; Sedes P.R.; Recalde D.; Recio-Fernandez E.; Resino S.; Ribeiro A.P.; Rivadeneira-Chamorro C.S.; Roa-Agudelo D.; Pardo M.R.; Rodriguez M.J.; Rodriguez-Artalejo F.; Rodriguez-Ferrer M.; Rodriguez-Gallego C.; Rodriguez-Garcia J.A.; Rodriguez-Hernandez M.A.; Rodriguez-Nicolas A.; Rodriguez-Palmero A.; Rodriguez-Ruiz E.; Rodriguez-Urrego P.A.; Maya B.R.; Novoa G.E.R.; Rojo F.; Romero-Coronado A.; Garcia F.R.; Rosa L.S.; Rosales-Castillo A.; Rubio C.; Olivera M.R.; Ruiz M.; Ruiz-Cabello F.; Ruiz-Casares E.; Ruiz-Cubillan J.J.; Ruiz-Hornillos J.; Ryan P.; Salamanca H.D.; Salazar-Garcia L.; Origlia G.G.S.; Sanchez P.-L.; Sanchez-Pablo C.; Sanchez-Pernaute O.; Sanchez Lopez A.J.; Prados M.C.S.; Real J.S.; Redondo J.S.; Sancho-Sainz C.; Sangil A.; Santos A.; Santos N.P.C.; Schluter A.; Segovia S.; Serra-Llovich A.; Puras F.S.; Porras M.S.; Sicolo M.A.; Silbiger V.N.; Silva N.S.; Silva F.T.C.; Fuentes C.S.; Sole-Violan J.; Soria J.M.; Sorli J.V.; Sousa R.R.; Souto J.C.; Souza K.S.C.; Souza V.S.; Sprockel J.J.; Suarez-Rama J.J.; Suarez-Zamora D.A.; Taboada-Fraga X.; Tamayo E.; Tamayo-Velasco A.; Taracido-Fernandez J.C.; Tavares N.A.C.; Telleria C.; Castano J.A.T.; Teper A.; Torres-Macho J.; Torres-Tobar L.; Torres Gutierrez R.P.; Troya J.; Urioste M.; Valencia-Ramos J.; Valido A.; Gallo J.P.V.; Varon B.; Vasconcelos R.H.T.; Vega T.; Velasco-Quirce S.; Velez-Santamaria V.; Victor V.; Estevez J.V.; Vieitez-Santiago M.; Vilches C.; Villalobos L.; Villar F.; Villar-Garcia J.; Villaverde C.; Villoslada-Blanco P.; Virseda-Berdices A.; Yanez Z.; Zapatero-Gaviria A.; Zarate R.; Zazo S.; de Heredia M.L.; Mendes I.; Moreno R.; Sande E.; Lapunzina P.; Alex B.; Andrikopoulos P.; Bach B.; Barclay W.S.; Bogaert D.; Chand M.; Chechi K.; Cooke G.S.; da Silva Filipe A.; de Silva T.; Docherty A.B.; dos Santos Correia G.; Dumas M.-E.; Dunning J.; Fletcher T.; Green C.A.; Greenhalf W.; Griffin J.; Gupta R.K.; Harrison E.M.; Ho A.Y.W.; Holden K.; Horby P.W.; Ijaz S.; Khoo S.; Klenerman P.; Lewis M.; Liggi S.; Lim W.S.; Maslen L.; Mentzer A.J.; Merson L.; Meynert A.M.; Moore S.C.; Noursadeghi M.; Olanipekun M.; Osagie A.; Palmarini M.; Palmieri C.; Paxton W.A.; Pollakis G.; Price N.; Rambaut A.; Robertson D.L.; Russell C.D.; Sancho-Shimizu V.; Sands C.; Scott J.T.; Sigfrid L.; Solomon T.; Sriskandan S.; Stuart D.; Swann O.V.; Takats Z.; Takis P.; Tedder R.S.; Thompson A.A.R.; Thomson E.C.; Thwaites R.S.; Turtle L.C.W.; Zambon M.; Carson G.; Drake T.M.; Fairfield C.J.; Knight S.R.; Mclean K.A.; Murphy D.; Norman L.; Pius R.; Shaw C.A.; Connor M.; Dalton J.; Gamble C.; Girvan M.; Halpin S.; Harrison J.; Jackson C.; Marsh L.; Roberts S.; Saviciute E.; Knight S.; Lahnsteiner E.; Leeming G.; Norris L.; Scott-Brown J.; Tait S.; Wham M.; Lee J.; Plotkin D.; Keating S.; Donegan C.; Spencer R.G.; Donohue C.; Hardwick H.; Shelton J.F.; Shastri A.J.; Ye C.; Weldon C.H.; Filshtein-Sonmez T.; Coker D.; Symons A.; Esparza-Gordillo J.; Aslibekyan S.; Auton A.; Yang J.; Ponting C.P.; Wilson J.F.; Vitart V.; Abedalthagafi M.; Luchessi A.D.; Parra E.J.; Cruz R.; Carracedo A.; Fawkes A.; Murphy L.; Rowan K.; Pereira A.C.; Law A.; Fairfax B.; Hendry S.C.; Baillie J.K.

Citation:
Nature. 617(7962) (pp 764-768), 2023. Date of Publication: 25 May 2023.

Abstract:
Critical illness in COVID-19 is an extreme and clinically homogeneous disease phenotype that we have previously shown<sup>1</sup> to be highly efficient for discovery of genetic associations<sup>2</sup>. Despite the advanced stage of illness at presentation, we have shown that host genetics in patients who are critically ill with COVID-19 can identify immunomodulatory therapies with strong beneficial effects in this group<sup>3</sup>. Here we analyse 24,202 cases of COVID-19 with critical illness comprising a combination of microarray genotype and whole-genome sequencing data from cases of critical illness in the international GenOMICC (11,440 cases) study, combined with other studies recruiting hospitalized patients with a strong focus on severe and critical disease: ISARIC4C (676 cases) and the SCOURGE consortium (5,934 cases). To put these results in the context of existing work, we conduct a meta-analysis of the new GenOMICC genome-wide association study (GWAS) results with previously published data. We find 49 genome-wide significant associations, of which 16 have not been reported previously. To investigate the therapeutic implications of these findings, we infer the structural consequences of protein-coding variants, and combine our GWAS results with gene expression data using a monocyte transcriptome-wide association study (TWAS) model, as well as gene and protein expression using Mendelian randomization. We identify potentially druggable targets in multiple systems, including inflammatory signalling (JAK1), monocyte-macrophage activation and endothelial permeability (PDE4A), immunometabolism (SLC2A5 and AK5), and host factors required for viral entry and replication (TMPRSS2 and RAB2A).

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Altmetrics:

Impelling Factors for Contracting COVID-19 Among Surgical Professionals During the Pandemic: A Multinational Cohort Study (2023)

Type of publication:Journal article

Author(s):Yang, Wah; Bangash, Ali Haider; Kok, Johnn Henry Herrera; Cheruvu, Chandra; Parmar, Chetan; Isik, Arda; Galanis, Michail; Di Maggio, Francesco; Atici, Semra Demirli; Abouelazayem, Mohamed; *Bandyopadhyay, Samik Kumar; Viswanath, Yirupaiahgari K S.

Citation:Journal of Clinical Medicine Research. 15(4):233-238, 2023 Apr.

Abstract:Background: Medical workers, including surgical professionals working in coronavirus disease 2019 (COVID-19) treating hospitals, were under enormous stress during the pandemic. This global study investigated factors endowing COVID-19 amongst surgical professionals and students. Methods: This global cross-sectional survey was made live on February 18, 2021 and closed for analysis on March 13, 2021. It was freely shared on social and scientific media platforms and was sent via email groups and circulated through a personal network of authors. Chi-square test for independence, and binary logistic regression analysis were carried out on determining predictors of surgical professionals contracting COVID-19. Results: This survey captured the response of 520 surgical professionals from 66 countries. Of the professionals, 92.5% (481/520) reported practising in hospitals managing COVID-19 patients. More than one-fourth (25.6%) of the respondents (133/520) reported suffering from COVID-19 which was more frequent in surgical professionals practising in public sector healthcare institutions (P = 0.001). Thirty-seven percent of those who reported never contracting COVID-19 (139/376) reported being still asked to practice self-isolation and wear a shield without the diagnosis (P = 0.001). Of those who did not contract COVID-19, 75.7% (283/376) were vaccinated (P < 0.001). Surgical professionals undergoing practice in the private sector (odds ratio (OR): 0.33; 95% confidence interval (CI): 0.14 – 0.77; P = 0.011) and receiving two doses of vaccine (OR: 0.55; 95% CI: 0.32 – 0.95; P = 0.031) were identified to enjoy decreased odds of contracting COVID-19. Only 6.9% of those who reported not contracting COVID-19 (26/376) were calculated to have the highest "overall composite level of harm" score (P < 0.001). Conclusions: High prevalence of respondents got COVID-19, which was more frequent in participants working in public sector hospitals. Those who reported contracting COVID-19 were calculated to have the highest level of harm score. Self-isolation or shield, getting two doses of vaccines decreases the odds of contracting COVID-19.

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Global impact of COVID-19 pandemic on gastric cancer patients (2023)

Type of publication:
Journal article

Author(s):
Herrera-Kok J.H.; Parmar C.; Bangash A.H.; Samadov E.; Demirli Atici S.; Cheruvu C.V.; Abouelazayem M.; Yang W.; Galanis M.; Di Maggio F.; Isik A.; *Bandopyadaya S.; Viswanath Y.K.

Citation:
European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology. (no pagination), 2023. Date of Publication: 02 Mar 2023.[epub ahead of print]

Abstract:

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Altmetrics:

Whole-genome sequencing reveals host factors underlying critical COVID-19 (2022)

Type of publication:
Journal article

Author(s):
Kousathanas A.; Pairo-Castineira E.; Rawlik K.; Stuckey A.; Odhams C.A.; Russell C.D.; Malinauskas T.; Wu Y.; Shen X.; Elliott K.S.; Griffiths F.; Oosthuyzen W.; Morrice K.; Keating S.; Wang B.; Rhodes D.; Klaric L.; Zechner M.; Parkinson N.; Siddiq A.; Goddard P.; Donovan S.; Maslove D.; Nichol A.; Semple M.G.; Zainy T.; Maleady-Crowe F.; Todd L.; Salehi S.; Knight J.; Elgar G.; Chan G.; Arumugam P.; Patch C.; Rendon A.; Bentley D.; Kingsley C.; Kosmicki J.A.; Horowitz J.E.; Baras A.; Abecasis G.R.; Ferreira M.A.R.; Justice A.; Mirshahi T.; Oetjens M.; Rader D.J.; Ritchie M.D.; Verma A.; Fowler T.A.; Shankar-Hari M.; Summers C.; Hinds C.; Horby P.; McAuley D.; Montgomery H.; Openshaw P.J.M.; Elliott P.; Walsh T.; Tenesa A.; Fawkes A.; Rowan K.; Ponting C.P.; Vitart V.; Wilson J.F.; Yang J.; Bretherick A.D.; Scott R.H.; Hendry S.C.; Moutsianas L.; Law A.; Caulfield M.J.; Baillie J.K.; Begg C.; Ling L.; Millar J.; Pereira A.C.; Aravindan L.; Armstrong R.; Biggs H.; Boz C.; Clark R.; Coutts A.; Coyle J.; Cullum L.; Das S.; Day N.; Donnelly L.; Finernan P.; Fourman M.H.; Furlong A.; Furniss J.; Gallagher B.; Gilchrist T.; Golightly A.; Hafezi K.; Hamilton D.; Hendry R.; Law D.; Law R.; Law S.; Lidstone-Scott R.; Macgillivray L.; Maclean A.; Mal H.; McCafferty S.; McMaster E.; Meikle J.; Moore S.C.; Murphy S.; Hellen M.; Zheng C.; Chen J.; Paterson T.; Schon K.; Stenhouse A.; Das M.; Swets M.; Szoor-McElhinney H.; Taneski F.; Turtle L.; Wackett T.; Ward M.; Weaver J.; Wrobel N.; Arbane G.; Bociek A.; Campos S.; Grau N.; Jones T.O.; Lim R.; Marotti M.; Ostermann M.; Whitton C.; Alldis Z.; Astin-Chamberlain R.; Bibi F.; Biddle J.; Blow S.; Bolton M.; Borra C.; Bowles R.; Burton M.; Choudhury Y.; Cox A.; Easthope A.; Ebano P.; Fotiadis S.; Gurasashvili J.; Halls R.; Hartridge P.; Kallon D.; Kassam J.; Lancoma-Malcolm I.; Matharu M.; May P.; Mitchelmore O.; Newman T.; Patel M.; Pheby J.; Pinzuti I.; Prime Z.; Prysyazhna O.; Shiel J.; Tierney C.; Wood S.; Zak A.; Zongo O.; Bonner S.; Hugill K.; Liggett S.; Headlam E.; Bandla N.; Gellamucho M.; Davies M.; Thompson C.; Abdelrazik M.; Bakthavatsalam D.; Elhassan M.; Ganesan A.; Haldeos A.; Moreno-Cuesta J.; Purohit D.; Vincent R.; Xavier K.; Frater A.; Saleem M.; Carter D.; Lamond Z.; Wall A.; Fernandez-Roman J.; Hamilton D.O.; Johnson E.; Johnston B.; Martinez M.L.; Mulla S.; Shaw D.; Waite A.A.C.; Waugh V.; Welters I.D.; Williams K.; Cavazza A.; Cockrell M.; Corcoran E.; Depante M.; Finney C.; Jerome E.; McPhail M.; Nayak M.; Noble H.; O'Reilly K.; Pappa E.; Saha S.; Knighton A.; Antcliffe D.; Banach D.; Brett S.; Coghlan P.; Fernandez Z.; Gordon A.; Rojo R.; Arias S.S.; Templeton M.; Meredith M.; Morris L.; Ryan L.; Clark A.; Sampson J.; Peters C.; Dent M.; Langley M.; Ashraf S.; Wei S.; Andrew A.; Bashyal A.; Davidson N.; Hutton P.; McKechnie S.; Wilson J.; Baptista D.; Crowe R.; Fernandes R.; Herdman-Grant R.; Joseph A.; O'Connor D.; Allen M.; Loveridge A.; McKenley I.; Morino E.; Naranjo A.; Simms R.; Sollesta K.; Swain A.; Venkatesh H.; Khera J.; Fox J.; Andrew G.; Barclay L.; Callaghan M.; Campbell R.; Clark S.; Hope D.; Marshall L.; McCulloch C.; Briton K.; Singleton J.; Birch S.; Brimfield L.; Daly Z.; Pogson D.; Rose S.; Nown A.; Battle C.; Brinkworth E.; Harford R.; Murphy C.; Newey L.; Rees T.; Williams M.; Arnold S.; Polgarova P.; Stroud K.; Meaney E.; Jones M.; Ng A.; Agrawal S.; Pathan N.; White D.; Daubney E.; Elston K.; Grauslyte L.; Hussain M.; Phull M.; Pogreban T.; Rosaroso L.; Salciute E.; Franke G.; Wong J.; George A.; de Gordoa L.O.-R.; Peasgood E.; Phillips C.; Bates M.; Dasgin J.; Gill J.; Nilsson A.; Scriven J.; Collins A.; Khaliq W.; Gude E.T.; Delgado C.C.; Dawson D.; Ding L.; Durrant G.; Ezeobu O.; Farnell-Ward S.; Kanu R.; Leaver S.; Maccacari E.; Manna S.; Saluzzio R.P.; Queiroz J.; Samakomva T.; Sicat C.; Texeira J.; Da Gloria E.F.; Lisboa A.; Rawlins J.; Mathew J.; Kinch A.; Hurt W.J.; Shah N.; Clark V.; Thanasi M.; Yun N.; Patel K.; Bennett S.; Goodwin E.; Jackson M.; Kent A.; Tibke C.; Woodyatt W.; Zaki A.; Abraheem A.; Bamford P.; Cawley K.; Dunmore C.; Faulkner M.; Girach R.; Jeffrey H.; Jones R.; London E.; Nagra I.; Nasir F.; Sainsbury H.; Smedley C.; Patel T.; Smith M.; Chukkambotla S.; Kazi A.; Hartley J.; Dykes J.; Hijazi M.; Keith S.; Khan M.; Ryan-Smith J.; Springle P.; Thomas J.; Truman N.; Saad S.; Coleman D.; Fine C.; Matt R.; Gay B.; Dalziel J.; Ali S.; Goodchild D.; Harling R.; Bhatterjee R.; Goddard W.; Davison C.; Duberly S.; Hargreaves J.; Bolton R.; Davey M.; Golden D.; Seaman R.; Cherian S.; Cutler S.; Heron A.E.; Roynon-Reed A.; Szakmany T.; Williams G.; Richards O.; Cheema Y.; Brooke H.; Buckley S.; Suarez J.C.; Charlesworth R.; Hansson K.; Norris J.; Poole A.; Rose A.; Sandhu R.; Sloan B.; Smithson E.; Thirumaran M.; Wagstaff V.; Metcalfe A.; Brunton M.; Caterson J.; Coles H.; Frise M.; Rai S.G.; Jacques N.; Keating L.; Tilney E.; Bartley S.; Bhuie P.; Gibson S.; Lyle A.; McNeela F.; Radhakrishnan J.; Hughes A.; Yates B.; Reynolds J.; Campbell H.; Thompsom M.; Dodds S.; Duffy S.; Greer S.; Shuker K.; Tridente A.; Khade R.; Sundar A.; Tsinaslanidis G.; Birkinshaw I.; Carter J.; Howard K.; Ingham J.; Joy R.; Pearson H.; Roche S.; Scott Z.; Bancroft H.; Bellamy M.; Carmody M.; Daglish J.; Moore F.; Rhodes J.; Sangombe M.; Kadiri S.; Croft M.; White I.; Frost V.; Aquino M.; Jha R.; Krishnamurthy V.; Lim L.; Combes E.; Joefield T.; Monnery S.; Beech V.; Trotman S.; Christine Almaden-Boyle; Austin P.; Cabrelli L.; Cole S.; Casey M.; Chapman S.; Whyte C.; Baird Y.; Butler A.; Chadbourn I.; Folkes L.; Fox H.; Gardner A.; Gomez R.; Hobden G.; Hodgson L.; King K.; Margarson M.; Martindale T.; Meadows E.; Raynard D.; Thirlwall Y.; Helm D.; Margalef J.; Criste K.; Cusack R.; Golder K.; Golding H.; Jones O.; Leggett S.; Male M.; Marani M.; Prager K.; Williams T.; Roberts B.; Salmon K.; Anderson P.; Archer K.; Austin K.; Davis C.; Durie A.; Kelsall O.; Thrush J.; Vigurs C.; Wild L.; Wood H.-L.; Tranter H.; Harrison A.; Cowley N.; McAlindon M.; Burtenshaw A.; Digby S.; Low E.; Morgan A.; Cother N.; Rankin T.; Clayton S.; McCurdy A.; Ahmed C.; Baines B.; Clamp S.; Colley J.; Haq R.; Hayes A.; Hulme J.; Hussain S.; Joseph S.; Kumar R.; Maqsood Z.; Purewal M.; Benham L.; Bradshaw Z.; Brown J.; Caswell M.; Cupitt J.; Melling S.; Preston S.; Slawson N.; Stoddard E.; Warden S.; Deacon B.; Lynch C.; Pothecary C.; Howe G.S.; Singh J.; Turner K.; Ellis H.; Stroud N.; Dearden J.; Dobson E.; Drummond A.; Mulcahy M.; Munt S.; O'Connor G.; Philbin J.; Rishton C.; Tully R.; Winnard S.; Cathcart S.; Duffy K.; Puxty A.; Puxty K.; Turner L.; Ireland J.; Semple G.; Long K.; Whiteley S.; Wilby E.; Ogg B.; Cowton A.; Kay A.; Kent M.; Potts K.; Wilkinson A.; Campbell S.; Brown E.; Melville J.; Naisbitt J.; Joseph R.; Lazo M.; Walton O.; Neal A.; Alexander P.; Allen S.; Bradley-Potts J.; Brantwood C.; Egan J.; Felton T.; Padden G.; Ward L.; Moss S.; Glasgow S.; Abel L.; Brett M.; Digby B.; Gemmell L.; Hornsby J.; MacGoey P.; O'Neil P.; Price R.; Rodden N.; Rooney K.; Sundaram R.; Thomson N.; Hopkins B.; Thrasyvoulou L.; Willis H.; Coulding M.; Jude E.; McCormick J.; Mercer O.; Potla D.; Rehman H.; Savill H.; Turner V.; Downes C.; Holding K.; Riches K.; Hilton M.; Hayman M.; Subramanian D.; Daniel P.; Adanini O.; Bhatia N.; Msiska M.; Collins R.; Clement I.; Gulati A.; Hays C.; Webster K.; Hudson A.; Webster A.; Stephenson E.; McCormack L.; Slater V.; Nixon R.; Hanson H.; Fearby M.; Kelly S.; Bridgett V.; Robinson P.; Camsooksai J.; Humphrey C.; Jenkins S.; Reschreiter H.; Wadams B.; Death Y.; Bastion V.; Clarke D.; David B.; Kent H.; Lorusso R.; Lubimbi G.; Murdoch S.; Penacerrada M.; Valentine J.; Vochin A.; Wulandari R.; Djeugam B.; Bell G.; English K.; Katary A.; Wilcox L.; Bruce M.; Connolly K.; Duncan T.; Michael H.T.; Lindergard G.; Hey S.; Fox C.; Alfonso J.; Durrans L.J.; Guerin J.; Blackledge B.; Harris J.; Hruska M.; Eltayeb A.; Lamb T.; Hodgkiss T.; Cooper L.; Rothwell J.; Allan A.; Anderson F.; Kaye C.; Liew J.; 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McFarland D.; Cosgrove D.; Ahmed A.; Morris A.; Jakkula S.; Nune A.; Brady M.; Dale S.; Dance A.; Gledhill L.; Greig J.; Hanson K.; Holdroyd K.; Home M.; Kelly D.; Kitson R.; Matapure L.; Melia D.; Mellor S.; Nortcliffe T.; Pinnell J.; Robinson M.; Shaw L.; Shaw R.; Thomis L.; Wilson A.; Wood T.; Bayo L.-A.; Merwaha E.; Ishaq T.; Hanley S.; Hibbert M.; Tetla D.; Woodford C.; Durga L.; Kennard-Holden G.; Branney D.; Frankham J.; Pitts S.; Laha S.; Verlander M.; Altabaibeh A.; Alvaro A.; Gilbert K.; Ma L.; Mostoles L.; Parmar C.; Jetha C.; Booker L.; Pratley A.; Adams C.; Agasou A.; Arden T.; Bowes A.; Boyle P.; Beekes M.; Button H.; Capps N.; Carnahan M.; Carter A.; Childs D.; Donaldson D.; Hard K.; Hurford F.; Hussain Y.; Javaid A.; Jones J.; Jose S.; Leigh M.; Martin T.; Millward H.; Motherwell N.; Rikunenko R.; Stickley J.; Summers J.; Ting L.; Tivenan H.; *Tonks L.; *Wilcox R.; Skinner D.; Gaylard J.; Mullan D.; Newman J.; Holland M.; Keenan N.; Lyons M.; Wassall H.; Marsh C.; Mahenthran M.; 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Middleton H.; Polgar O.; Nolan C.; Mahay K.; Collier D.; Hormis A.; Maynard V.; Graham C.; Walker R.; Knights E.; Price A.; Thomas A.; Thorpe C.; Behan T.; Burnett C.; Hatton J.; Heeney E.; Mitra A.; Newton M.; Pollard R.; Stead R.; Amin V.; Anastasescu E.; Anumakonda V.; Karthik K.; Kausar R.; Reid K.; Smith J.; Imeson-Wood J.; Brown A.; Crickmore V.; Debreceni G.; Wilkins J.; Nicol L.; Reece-Anthony R.; Birt M.; Ghosh A.; Williams E.; Allen L.; Beranova E.; Crisp N.; Deery J.; Hazelton T.; Knight A.; Price C.; Tilbey S.; Turki S.; Turney S.; Cooper J.; Finch C.; Liderth S.; Quinn A.; Waddington N.; Coventry T.; Fowler S.; MacMahon M.; Cowley A.; Highgate J.; Gregory J.; O'Connell S.; Smith T.; Barberis L.; Gopal S.; Harris N.; Lake V.; Metherell S.; Radford E.; Daniel A.; Finn J.; Saha R.; White N.; Donnison P.; Trim F.; Eapen B.; Birch J.; Bough L.; Goodsell J.; Tutton R.; Williams P.; Williams S.; Winter-Goodwin B.; Brickell K.; Smyth M.; Murphy L.; Coetzee S.; Gales A.; Raj M.; Sell C.; Hilltout P.; Evitts J.; Tyler A.; Waldron J.; Beesley K.; Board S.; Kubisz-Pudelko A.; Lewis A.; Perry J.; Pippard L.; Wood D.; Buckley C.; Barry P.; Flint N.; Rekha P.; Hales D.; Bunni L.; Jennings C.; Latif M.; Marshall R.; Subramanian G.; McGuigan P.J.; Wasson C.; Finn S.; Green J.; Collins E.; King B.; Smuts S.; Duffield J.; Smith O.; Mallon L.; Watkins C.; Botfield L.; Butler J.; Dexter C.; Fletcher J.; Garg A.; Kuravi A.; Ranga P.; Virgilio E.; Belagodu Z.; Fuller B.; Gherman A.; Olufuwa O.; Paramsothy R.; Stuart C.; Oakley N.; Kamundi C.; Tyl D.; Collins K.; Silva P.; Taylor J.; King L.; Coates C.; Crowley M.; Wakefield P.; Beadle J.; Johnson L.; Sargeant J.; Anderson M.; Brady A.; Chan R.; Little J.; McIvor S.; Prady H.; Whittle H.; Mathew B.; Attwood B.; Parsons P.; Ward G.; Bremmer P.; Joe W.; Tracy B.; Jim R.; Davies E.; Roche L.; Sathe S.; Dennis C.; McGregor A.; Parris V.; Srikaran S.; Sukha A.; Clarke N.; Whiteside J.; Mascarenhas M.; Donaldson A.; Matheson J.; Barrett F.; O'Hara M.; Okeefe L.; Bradley C.; Eastgate-Jackson C.; Filipe H.; Martin D.; Maharajh A.; Garcia S.M.; Pakou G.; De Neef M.; Dent K.; Horsley E.; Akhtar M.N.; Pearson S.; Potoczna D.; Spencer S.; Clapham M.; Harper R.; Poultney U.; Rice P.; Mutch R.; Armstrong L.; Bates H.; Dooks E.; Farquhar F.; Hairsine B.; McParland C.; Packham S.; Bi R.; Scholefield B.; Ashton L.; George L.; Twiss S.; Wright D.; Chablani M.; Kirkby A.; Netherton K.; Davies K.; O'Brien L.; Omar Z.; Otahal I.; Perkins E.; Lewis T.; Sutherland I.; Burns K.; Chandler B.; Elliott K.; Mallinson J.; Turnbull A.; Gondo P.; Hadebe B.; Kayani A.; Masunda B.; Anderson T.; Hawcutt D.; O'Malley L.; Rad L.; Rogers N.; Saunderson P.; Allison K.S.; Afolabi D.; Whitbread J.; Jones D.; Dore R.; Halkes M.; Mercer P.; Thornton L.; Dawson J.; Garrioch S.; Tolson M.; Aldridge J.; Kapoor R.; Loader D.; Castle K.; Humphreys S.; Tampsett R.; Mackintosh K.; Ayers A.; Harrison W.; North J.; Allibone S.; Genetu R.; Kasipandian V.; Patel A.; Mac A.; Murphy A.; Mahjoob P.; Nazari R.; Worsley L.; Fagan A.; Bemand T.; Black E.; Rosa A.D.; Howle R.; Jhanji S.; Baikady R.R.; Tatham K.C.; Thomas B.; Bell D.; Boyle R.; Douglas K.; Glass L.; Lee E.; Lennon L.; Rattray A.; Taylor A.; Hughes R.A.; Thomas H.; Rees A.; Duskova M.; Phipps J.; Brooks S.; Edwards M.; Quaid S.; Watson E.; Brayne A.; Fisher E.; Hunt J.; Jackson P.; Kaye D.; Love N.; Parkin J.; Tuckey V.; van Koutrik L.; Carter S.; Andrew B.; Findlay L.; Adams K.; Service J.; Williams A.; Cheyne C.; Saunderson A.; Moultrie S.; Odam M.; Hall K.; Mapfunde I.; Willis C.; Lyon A.; Sri-Chandana C.; Scherewode J.; Stephenson L.; Marsh S.; Hardy J.; Houlden H.; Moncur E.; Tariq A.; Tucci A.; Hobrok M.; Loosley R.; McGuinness H.; Tench H.; Wolf-Roberts R.; Irvine V.; Shelley B.; Gorman C.; Gupta A.; Timlick E.; Brady R.; Milligan B.; Bellini A.; Bryant J.; Mayer A.; Pickard A.; Roe N.; Sowter J.; Howlett A.; Fidler K.; Tagliavini E.; Donnelly K.; Shelton J.F.; Shastri A.J.; Ye C.; Weldon C.H.; Filshtein-Sonmez T.; Coker D.; Symons A.; Esparza-Gordillo J.; Aslibekyan S.; Auton A.; Pathak G.A.; Karjalainen J.; Stevens C.; Andrews S.J.; Kanai M.; Cordioli M.; Polimanti R.; Pirinen M.; Harerimana N.; Veerapen K.; Wolford B.; Nguyen H.; Solomonson M.; Liao R.G.; Chwialkowska K.; Trankiem A.; Balaconis M.K.; Hayward C.; Richmond A.; Campbell A.; Morris M.; Fawns-Ritchie C.; Glessner J.T.; Shaw D.M.; Chang X.; Polikowski H.; Petty L.E.; Chen H.-H.; Wanying Z.; Porteous D.J.; Below J.; North K.; McCormick J.B.; Timmers P.H.J.; D'Mellow K.; Kerr S.M.; Niemi M.E.K.; von Hohenstaufen K.A.; Sobh A.; Eltoukhy M.M.; Yassen A.M.; Hegazy M.A.F.; Okasha K.; Eid M.A.; Moahmed H.S.; Shahin D.; El-Sherbiny Y.M.; Elhadidy T.A.; Abd Elghafar M.S.; El-Jawhari J.J.; Mohamed A.A.S.; Elnagdy M.H.; Samir A.; Abdel-Aziz M.; Khafaga W.T.; El-Lawaty W.A.; Torky M.S.; El-shanshory M.R.; Batini C.; Lee P.H.; Shrine N.; Williams A.T.; Tobin M.D.; Guyatt A.L.; John C.; Packer R.J.; Ali A.; Free R.C.; Wang X.; Wain L.V.; Hollox E.J.; Venn L.D.; Bee C.E.; Adams E.L.; Niavarani A.; Sharififard B.; Aliannejad R.; Amirsavadkouhi A.; Naderpour Z.; Tadi H.A.; Aleagha A.E.; Ahmadi S.; Moghaddam S.B.M.; Adamsara A.; Saeedi M.; Abdollahi H.; Hosseini A.; Chariyavilaskul P.; Chamnanphon M.; Suttichet T.B.; Shotelersuk V.; Pongpanich M.; Phokaew C.; Chetruengchai W.; Jantarabenjakul W.; Putchareon O.; Torvorapanit P.; Puthanakit T.; Suchartlikitwong P.; Hirankarn N.; Nilaratanakul V.; Sodsai P.; Brumpton B.M.; Hveem K.; Willer C.; Zhou W.; Rogne T.; Solligard E.; Asvold B.O.; Abedalthagafi M.; Alaamery M.; Alqahtani S.; Barakeh D.; Harthi F.A.; Alsolm E.; Safieh L.A.; Alowayn A.M.; Alqubaishi F.; Mutairi A.A.; Mangul S.; Alshareef A.; Sawaji M.; Almutairi M.; Aljawini N.; Albesher N.; Arabi Y.M.; Mahmoud E.S.; Khattab A.K.; Halawani R.T.; Alahmadey Z.Z.; Albakri J.K.; Felemban W.A.; Suliman B.A.; Hasanato R.; Al-Awdah L.; Alghamdi J.; AlZahrani D.; AlJohani S.; Al-Afghani H.; Alrashed M.; AlDhawi N.; AlBardis H.; Alkwai S.; Alswailm M.; Almalki F.; Albeladi M.; Almohammed I.; Barhoush E.; Albader A.; Massadeh S.; AlMalik A.; Alotaibi S.; Alghamdi B.; Jung J.; Fawzy M.S.; Lee Y.; Magnus P.; Trogstad L.-I.S.; Helgeland O.; Harris J.R.; Mangino M.; Spector T.D.; Duncan E.; Smieszek S.P.; Przychodzen B.P.; Polymeropoulos C.; Polymeropoulos V.; Polymeropoulos M.H.; Fernandez-Cadenas I.; Perez-Tur J.; Llucia-Carol L.; Cullell N.; Muino E.; Carcel-Marquez J.; DeDiego M.L.; Iglesias L.L.; Planas A.M.; Soriano A.; Rico V.; Aguero D.; Bedini J.L.; Lozano F.; Domingo C.; Robles V.; Ruiz-Jaen F.; Marquez L.; Gomez J.; Coto E.; Albaiceta G.M.; Garcia-Clemente M.; Dalmau D.; Arranz M.J.; Dietl B.; Serra-Llovich A.; Soler P.; Colobran R.; Martin-Nalda A.; Martinez A.P.; Bernardo D.; Rojo S.; Fiz-Lopez A.; Arribas E.; de la Cal-Sabater P.; Segura T.; Gonzalez-Villa E.; Serrano-Heras G.; Marti-Fabregas J.; Jimenez-Xarrie E.; Mimbrera A.F.; Masjuan J.; Garcia-Madrona S.; Dominguez-Mayoral A.; Villalonga J.M.; Menendez-Valladares P.; Chasman D.I.; Buring J.E.; Ridker P.M.; Franco G.; Sesso H.D.; Manson J.E.; Glessner J.R.; Hakonarson H.; Medina-Gomez C.; Uitterlinden A.G.; Ikram M.A.; Kristiansson K.; Koskelainen S.; Perola M.; Donner K.; Kivinen K.; Palotie A.; Ripatti S.; Ruotsalainen S.; Kaunisto M.; Nakanishi T.; Butler-Laporte G.; Forgetta V.; Morrison D.R.; Ghosh B.; Laurent L.; Belisle A.; Henry D.; Abdullah T.; Adeleye O.; Mamlouk N.; Kimchi N.; Afrasiabi Z.; Rezk N.; Vulesevic B.; Bouab M.; Guzman C.; Petitjean L.; Tselios C.; Xue X.; Schurr E.; Afilalo J.; Afilalo M.; Oliveira M.; Brenner B.; Lepage P.; Ragoussis J.; Auld D.; Brassard N.; Durand M.; Chasse M.; Kaufmann D.E.; Lathrop G.M.; Mooser V.; Richards J.B.; Li R.; Adra D.; Rahmouni S.; Georges M.; Moutschen M.; Misset B.; Darcis G.; Guiot J.; Guntz J.; Azarzar S.; Gofflot S.; Beguin Y.; Claassen S.; Malaise O.; Huynen P.; Meuris C.; Thys M.; Jacques J.; Leonar P.; Frippiat F.; Giot J.-B.; Sauvage A.-S.; von Frenckell C.; Belhaj Y.; Lambermont B.; Pigazzini S.; Daya M.; Shortt J.; Rafaels N.; Wicks S.J.; Crooks K.; Barnes K.C.; Gignoux C.R.; Chavan S.; Laisk T.; Lall K.; Lepamets M.; Magi R.; Esko T.; Reimann E.; Milani L.; Alavere H.; Metsalu K.; Puusepp M.; Metspalu A.; Naaber P.; Laane E.; Pesukova J.; Peterson P.; Kisand K.; Tabri J.; Allos R.; Hensen K.; Starkopf J.; Ringmets I.; Tamm A.; Kallaste A.; Bochud P.-Y.; Rivolta C.; Bibert S.; Quinodoz M.; Kamdar D.; Boillat N.; Nussle S.G.; Albrich W.; Suh N.; Neofytos D.; Erard V.; Voide C.; de Cid R.; Galvan-Femenia I.; Blay N.; Carreras A.; Cortes B.; Farre X.; Sumoy L.; Moreno V.; Mercader J.M.; Guindo-Martinez M.; Torrents D.; Kogevinas M.; Garcia-Aymerich J.; Castano-Vinyals G.; Dobano C.; Renieri A.; Mari F.; Fallerini C.; Daga S.; Benetti E.; Baldassarri M.; Fava F.; Frullanti E.; Valentino F.; Doddato G.; Giliberti A.; Tita R.; Amitrano S.; Bruttini M.; Croci S.; Meloni I.; Mencarelli M.A.; Rizzo C.L.; Pinto A.M.; Beligni G.; Tommasi A.; Sarno L.D.; Palmieri M.; Carriero M.L.; Alaverdian D.; 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Capasso M.; Russo R.; Andolfo I.; Iolascon A.; Fiorentino G.; Carella M.; Castori M.; Merla G.; Squeo G.M.; Aucella F.; Raggi P.; Marciano C.; Perna R.; Bassetti M.; Biagio A.D.; Sanguinetti M.; Masucci L.; Valente S.; Mandala M.; Giorli A.; Salerni L.; Zucchi P.; Parravicini P.; Menatti E.; Trotta T.; Giannattasio F.; Coiro G.; Lena F.; Coviello D.A.; Mussini C.; Martinelli E.; Mancarella S.; Tavecchia L.; Crotti L.; Gabbi C.; Rizzi M.; Maggiolo F.; Ripamonti D.; Bachetti T.; Rovere M.T.L.; Sarzi-Braga S.; Bussotti M.; Ceri S.; Pinoli P.; Raimondi F.; Biscarini F.; Stella A.; Zguro K.; Capitani K.; Suardi C.; Dei S.; Parati G.; Ravaglia S.; Artuso R.; Botta G.; Di Domenico P.; Rancan I.; Perrella A.; Bianchi F.; Romani D.; Bergomi P.; Catena E.; Colombo R.; Tanfoni M.; Vincenti A.; Ferri C.; Grassi D.; Pessina G.; Tumbarello M.; Di Pietro M.; Sabrina R.; Luchi S.; Barbieri C.; Acquilini D.; Andreucci E.; Segala F.V.; Tiseo G.; Falcone M.; Lista M.; Poscente M.; De Vivo O.; Petrocelli P.; 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Do R.; Hoggart C.; Choi S.; Underwood S.J.; O'Reilly P.; Huckins L.M.; Zyndorf M.; Daly M.J.; Neale B.M.; Ganna A.

Citation:
Nature, 2022. Vol 607(7917) (pp 97-103)

Abstract:
Critical COVID-19 is caused by immune-mediated inflammatory lung injury. Host genetic variation influences the development of illness requiring critical care1 or hospitalization2-4 after infection with SARS-CoV-2. The GenOMICC (Genetics of Mortality in Critical Care) study enables the comparison of genomes from individuals who are critically ill with those of population controls to find underlying disease mechanisms. Here we use whole-genome sequencing in 7,491 critically ill individuals compared with 48,400 controls to discover and replicate 23 independent variants that significantly predispose to critical COVID-19. We identify 16 new independent associations, including variants within genes that are involved in interferon signalling (IL10RB and PLSCR1), leucocyte differentiation (BCL11A) and blood-type antigen secretor status (FUT2). Using transcriptome-wide association and colocalization to infer the effect of gene expression on disease severity, we find evidence that implicates multiple genes-including reduced expression of a membrane flippase (ATP11A), and increased expression of a mucin (MUC1)-in critical disease. Mendelian randomization provides evidence in support of causal roles for myeloid cell adhesion molecules (SELE, ICAM5 and CD209) and the coagulation factor F8, all of which are potentially druggable targets. Our results are broadly consistent with a multi-component model of COVID-19 pathophysiology, in which at least two distinct mechanisms can predispose to life-threatening disease: failure to control viral replication; or an enhanced tendency towards pulmonary inflammation and intravascular coagulation. We show that comparison between cases of critical illness and population controls is highly efficient for the detection of therapeutically relevant mechanisms of disease.

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Pregnancy and neonatal outcomes of COVID-19: The PAN-COVID study (2022)

Type of publication:Journal article

Author(s):Mullins E; Perry A; Banerjee J; Townson J; Grozeva D; Milton R; Kirby N; Playle R; Bourne T; Lees C; PAN-COVID Investigators (including *Millward, H.)

Citation:European Journal of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Biology, 2022 Sep; Vol. 276, pp. 161-167.

Abstract:Objective: To assess perinatal outcomes for pregnancies affected by suspected or confirmed SARS-CoV-2 infection.Methods: Prospective, web-based registry. Pregnant women were invited to participate if they had suspected or confirmed SARS-CoV-2 infection between 1st January 2020 and 31st March 2021 to assess the impact of infection on maternal and perinatal outcomes including miscarriage, stillbirth, fetal growth restriction, pre-term birth and transmission to the infant.Results: Between April 2020 and March 2021, the study recruited 8239 participants who had suspected or confirmed SARs-CoV-2 infection episodes in pregnancy between January 2020 and March 2021. Maternal death affected 14/8197 (0.2%) participants, 176/8187 (2.2%) of participants required ventilatory support. Pre-eclampsia affected 389/8189 (4.8%) participants, eclampsia was reported in 40/ 8024 (0.5%) of all participants. Stillbirth affected 35/8187 (0.4 %) participants. In participants delivering within 2 weeks of delivery 21/2686 (0.8 %) were affected by stillbirth compared with 8/4596 (0.2 %) delivering ≥ 2 weeks after infection (95 % CI 0.3-1.0). SGA affected 744/7696 (9.3 %) of livebirths, FGR affected 360/8175 (4.4 %) of all pregnancies. Pre-term birth occurred in 922/8066 (11.5%), the majority of these were indicated pre-term births, 220/7987 (2.8%) participants experienced spontaneous pre-term births. Early neonatal deaths affected 11/8050 livebirths. Of all neonates, 80/7993 (1.0%) tested positive for SARS-CoV-2.Conclusions: Infection was associated with indicated pre-term birth, most commonly for fetal compromise. The overall proportions of women affected by SGA and FGR were not higher than expected, however there was the proportion affected by stillbirth in participants delivering within 2 weeks of infection was significantly higher than those delivering ≥ 2 weeks after infection. We suggest that clinicians' threshold for delivery should be low if there are concerns with fetal movements or fetal heart rate monitoring in the time around infection. The proportion affected by pre-eclampsia amongst participants was not higher than would be expected, although we report a higher than expected proportion affected by eclampsia. There appears to be no effect on birthweight or congenital malformations in women affected by SARS-CoV-2 infection in pregnancy and neonatal infection is uncommon. This study reflects a population with a range of infection severity for SARS-COV-2 in pregnancy, generalisable to whole obstetric populations.

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Antibody decay, T cell immunity and breakthrough infections following two SARS-CoV-2 vaccine doses in inflammatory bowel disease patients treated with infliximab and vedolizumab (2022)

Type of publication:Journal article

Author(s):Lin S.; Kennedy N.A.; Saifuddin A.; Sandoval D.M.; Reynolds C.J.; Seoane R.C.; Kottoor S.H.; Pieper F.P.; Lin K.-M.; Butler D.K.; Chanchlani N.; Nice R.; Chee D.; Bewshea C.; Janjua M.; McDonald T.J.; Sebastian S.; Alexander J.L.; Constable L.; Lee J.C.; Murray C.D.; Hart A.L.; Irving P.M.; Jones G.-R.; Lees C.W.; Altmann D.M.; Boyton R.J.; Goodhand J.R.; Powell N.; Kok K.B.; Bokth F.; Cipriano B.; Francia C.; Khalid N.; Khatun H.; Kingston A.; Lee I.; Lehmann A.; Naik K.; Pabriaga E.; Plaatjies N.; Samuels K.; Saich R.; Cousins H.; Thomas R.; Brown M.; White B.; Tilley B.; Muhammed R.; Bi R.; Cotter C.; Grove J.; Hong K.; Howman R.; Clayton S.; Sultan S.; Rooney M.; Cottrill C.; Singh S.; Dawe C.; Hull R.; Silva N.; Manning J.; Finlayson L.; Roebuck A.; Dawson J.; Sonwalkar S.; Chambers N.; Robinson M.; Haigh A.; Matapure L.; Raine T.; Kapizioni C.; Strongili K.; Thompson T.; Ahmed M.; Kontos C.; Bourges C.; Barbutti I.; Gozzard M.E.; Hendy P.; Bull R.; Costa P.; Davey L.; Hannington H.; Nundlall K.; Martins C.; Avanzi L.; Carungcong J.; Barr S.; Appleby R.; Johnson E.; Phillis K.; Gascoyne R.; Crowder A.; Whileman A.; London I.; Grounds J.; Martin E.; Price J.; Cawley K.; Dhar A.; Brown E.; Cowton A.; Warner B.; Stuart C.; Lacey L.; de Silva S.; Allcock C.; Harvey P.; Jones L.; Cooke E.; Brooks J.; Baker P.; Beadle H.; Cruz C.; Potter D.; Collum J.; Masters F.; Kumar A.; Coetzee S.; Peiu M.; Icke B.; Raj M.; Gaynor E.; Chadokufa S.; Huggett B.; Meghari H.; El-Khouly S.; Kiparissi F.; Girshab W.; Claridge A.; Fowler E.; McCafferty L.; Christodoulides K.; Clifford A.; Dawson P.; Honap S.; Lim S.; Luber R.; Mahiouz K.; Meade S.; Reynolds R.; Stanton A.; Tripoli S.; Hare N.; Balachandran S.; North E.; North J.; Browne B.; Jameson E.; Siaw Y.H.; Manzano L.; Segal J.; Al-Bakir I.; Khakoo I.; Thoua N.; Davidson K.; Miah J.; Canclini L.; Hall A.; Hayes M.; Myers S.; Talbot A.; Turnbull J.; Whitehead E.; Stamp K.; Pattinson A.; Mathew V.; Sherris L.; Harvey A.; Hicks L.; Byrne T.-M.; Cabreros L.; Downing-Wood H.; Hunter S.; Prabhudev H.; Balarajah S.; Ibraheim H.; Torkizadeh M.; Lo J.W.; Liu Z.; Sutherland H.; Wilhelmsen E.; Mackintosh K.; Verma A.M.; Sebastian J.; Peerally M.F.; Raymode P.; Guerdette A.-M.; Kent A.; Choong L.M.; Pantaloni B.; Ravdas P.; Vadamalayan B.; Foley S.; Arnold B.; Heeley C.; Lovegrove W.; Sowton D.; Allsop L.; Gregory H.; Smith P.J.; Bretland G.; King S.; Lofthouse M.; Rigby L.; Subramanian S.; Tyrer D.; Martin K.; Probert C.; Kamperidis N.; Adedoyin T.; Baden M.; Chacko F.; Cicchetti M.; Saifuddin M.A.; Yesupatham P.; Gowda R.; Williams M.; Kemp K.; Akhand R.; Gray G.; John A.; John M.; Mohammed T.; Sathe D.; Jones N.; Soren J.; Sprakes M.; Burton J.; Kane P.; Lupton S.; Bartholomew J.; MacFaul G.; Scaletta D.; Siamia L.; Williams F.; Green C.; Ver Z.; Lamb C.A.; Doona M.; Hogg A.; Jeffrey L.; King A.; Speight R.A.; Doyle J.; Owen R.; Mowat C.; Rice D.; MacFarlane S.; MacLeod A.; Mohammed S.; Murray S.; Elliott A.; Morris M.A.; Coke L.; Hindle G.; Kolokouri E.; Wright C.; Lee C.; Ward N.; Dann A.; Lockett M.; Cranfield C.; Jennings L.; Srivastava A.; Ward L.; Jeynes N.; Ranga P.; Rajasekhar P.; Gallagher L.; Patterson L.; Ward J.; Basnett R.; Murphy J.; Parking L.; Lawson E.; Short S.; Devadason D.; Moran G.; Khan N.; Tarr L.; Olivia C.; Limdi J.; Goulden K.; Javed A.; McKenzie L.; Bhandari P.; Baker-Moffatt M.; Dash J.; Le Poidevin A.; Downe H.; Bombeo L.; Blackman H.; Wiles A.; Bloxham H.; Dias J.; Nadar E.; Curgenven H.; Macdonald J.; Finan S.; McMeeken F.; Mahmood M.; Shields S.; Seenan J.P.; DeSilva D.; Malkakorpi S.; Carson R.; Whiteoak S.; Edger-Earley K.; Vamplew L.; Ingram S.; Botfield S.; Hammonds F.; James C.; Ahmad T.; Aspinall G.; Hawkins S.; Marriott S.; Redstone C.; Windak H.; Adam A.-M.; Mabb H.; Murray C.; Diaba C.; Joseph F.; Pakou G.; Gleeson Y.; Berrill J.; Stroud N.; Pothecary C.; Roche L.; Turner K.; Deering L.; Israel L.; Baker E.; Cutler S.; Evans R.M.; Nash M.; Mallison G.; Roynon A.; Gordon J.; Levell E.; Zagalo S.; Fraser W.; Hoad I.; Kirkineziadis N.; Russell R.; Henderson P.; Millar M.; Fagbemi A.; Jennings F.; Mayor I.; Wilson J.; Alexakis C.; Michalak N.; Saunders J.; Burton H.; Cambridge V.; Clark T.; Ekblad C.; Hierons S.; Katebe J.; Saunsbury E.; Perry R.; Brookes M.; Davies K.; Green M.; Plumbe A.; Ormerod C.; Christensen H.; Keen A.; Ogor J.; Anthony A.; Newitt E.; Trim F.; Casey R.; Seymour K.; Fogden E.; Russell K.; Phillips A.; Abdulla M.; *Butterworth J.; *Adams C.; *Buckingham E.; *Childs D.; *Magness A.; *Stickley J.; *Motherwell N.; *Tonks L.; *Gibson H.; *Pajak S.; Thomas C.; Brinkworth E.; Connor L.; Cook A.; Rees T.; Harford R.; Wesley E.; Moss A.; Lucas J.; Lorimer C.; Oleary M.; Dixon M.; Ramadas A.; Tregonning J.; Okeke O.; Jackson W.; Koumoutsos I.; George V.; Kunhunny S.; Laverick S.; Anderson I.; Smith S.; Patel K.; Ali M.; Mhandu H.; Rana A.; Spears K.; Teixeira J.; Pollok R.; Mencias M.; Seaward A.; Sousa J.; Said N.; Soomaroo M.; Raspa V.; Tacouri A.; Reps N.; Martin R.; Selinger C.; Carbonell J.; Onovira F.; Quartey D.; L'Anson A.; Ashworth A.; Bailey J.; Dunn A.; Mahmood Z.; Campbell R.; Marsh L.; Rahman M.; Davies S.; Habibi R.; Jessup-Dunton E.; Joefield T.; Layug R.; Patel V.; Vere J.; Turner V.; Kilroy S.; Walker G.; Atkins S.; Growdon J.; McNeill C.; Cooney R.; Bennett L.; Bowlas L.; Shariff S.; Fraser A.; Punnette D.; Bishop-Hurman C.; Undrell E.; Belfield K.; Din S.; Addleton C.; Appleby M.; Brown J.; Holding K.; Hooper P.; deCaestecker J.; Watchorn O.; Hayward C.; Inniss S.; Pritchard L.; Rudge K.; Carney A.; Andreyev J.; Hayhurst C.; Lockwood C.; Osborne L.; Roper A.; Warner K.; Hindle J.; Watt C.; Szymiczek K.; Mehta S.; Bell J.; Blad W.; Whitley L.; Dhamaraj D.; Baker M.; Sivamurugan E.J.; Evans M.; Cummings F.; Harris C.; Jones A.; Krauze L.; Rahmany S.; Earl M.; Vowles J.; Torokwa A.; Petrova M.; Procter A.; Stanley J.; Silvamoniz C.; Bettey M.; Wahid A.; Morrison Z.; Thomas-Turner R.; Yendle L.; Muller J.; Mitchell M.; Kirkwood J.; Barnes A.; Chaudhary R.; Claridge M.; Ellis C.; Kemp C.; Tobi O.; Milton J.; Johnston E.; Oblak M.; Godden J.; Lees C.; Alexander D.; Covil K.; Derikx L.; Siakavellas S.; Baxter H.; Robertson S.; Smith L.; Poulose B.; Colemam A.; Balint M.; Rhys-Jones G.; Johns K.; Hughes R.; Phipps J.; Taylor A.; MacPhee C.; Brooks S.; Smith K.; Howard L.; Wood D.; Muddu A.; Barman L.; Mallinson J.; Neale T.; Ionita D.; Elliot K.; Turnball A.; Thomas I.; Andrews K.; Sutton J.; Jones C.M.; Roberts J.; Bishop J.

Citation:Nature Communications. 13(1) (no pagination), 2022. Article Number: 1379. Date of Publication: December 2022 [epub ahead of print]

Abstract:Anti tumour necrosis factor (anti-TNF) drugs increase the risk of serious respiratory infection and impair protective immunity following pneumococcal and influenza vaccination. Here we report SARS-CoV-2 vaccine-induced immune responses and breakthrough infections in patients with inflammatory bowel disease, who are treated either with the anti-TNF antibody, infliximab, or with vedolizumab targeting a gut-specific anti-integrin that does not impair systemic immunity. Geometric mean [SD] anti-S RBD antibody concentrations are lower and half-lives shorter in patients treated with infliximab than vedolizumab, following two doses of BNT162b2 (566.7 U/mL [6.2] vs 4555.3 U/mL [5.4], p <0.0001; 26.8 days [95% CI 26.2 – 27.5] vs 47.6 days [45.5 – 49.8], p <0.0001); similar results are also observed with ChAdOx1 nCoV-19 vaccination (184.7 U/mL [5.0] vs 784.0 U/mL [3.5], p <0.0001; 35.9 days [34.9 – 36.8] vs 58.0 days [55.0 – 61.3], p value < 0.0001). One fifth of patients fail to mount a T cell response in both treatment groups. Breakthrough SARS-CoV-2 infections are more frequent (5.8% (201/3441) vs 3.9% (66/1682), p = 0.0039) in patients treated with infliximab than vedolizumab, and the risk of breakthrough SARS-CoV-2 infection is predicted by peak anti-S RBD antibody concentration after two vaccine doses. Irrespective of the treatments, higher, more sustained antibody levels are observed in patients with a history of SARS-CoV-2 infection prior to vaccination. Our results thus suggest that adapted vaccination schedules may be required to induce immunity in at-risk, anti-TNF-treated patients.

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